On l’a vu précédemment, la première église de Warquignies fut érigée en 1770 à partir de la chapelle existante sur ordre du seigneur Bauduin-Justin de Grouff. Succursale de l’église de Wasmes, celle-ci permettait de célébrer baptêmes, mariages et décès. Devenue trop petite pour accueillir les paroissiens (rappelons que la plupart des habitants domiciliés à Petit-Wasmes, Petit-Hornu et Résignies venaient s’ajouter à ceux du village), on collecta auprès des fidèles pour agrandir la paroisse. C’est dès lors en 1804 que commencèrent les travaux d’agrandissement. La nef gagna 10 mètres, les murs furent dotés de fenêtres et de portes. La nouvelle façade reçut une double porte ainsi qu’un œil-de-bœuf. Une petite tour carrée renfermant la cloche et surmontée d’une flèche parachevait le tout. Après avoir passé diverses périodes de crises, notamment la suppression de la célébration de 1807 à 1809 suite à quoi les prêtres faisant messe devaient se déplacer de Wasmes, un incendie éclata en 1818, engendrant des dégâts assez importants. Une fois de plus, la population fut mise à contribution pour financer la réparation de l’édifice. C’est en 1836 que l’église devint autonome. Plus besoin de passer par Notre Dame de Wasmes pour les communions. Le premier curé de Warquignies s’appelait alors Antoine Delaunois. Une horloge fut installée en 1865 dans la tour.
A la fin du 19ème siècle, l’église était dans un tel état de délabrement qu’il fut envisagé de la démolir complètement après avoir construit l’église, la place et la rue de l’Eglise que nous connaissons actuellement. Le conseil communal emprunta la somme de 10000fr pour venir l’ajouter au 20000fr de don de Monseigneur Du Rousseaux (Evêque de Tournai), au 10000fr du gouvernement, au 7500fr donnés et recueillis par le Curé et aux 3000fr récupérés sur les vieux matériaux. En outre, le curé s’engageait à recueillir l’argent manquant nécessaire à finaliser les travaux et c’est le 15 mai 1898 que fut bénie et posée la première pierre de l’édifice.
La bénédiction et l’inauguration de l’église eurent lieu le 17 juin 1899 lors du mardi de la Pentecôte. L’ancienne église fut donc rasée et son horloge installée dans le nouveau clocher, de même que la cloche.
Désormais, le cimetière, alors attenant à l’ancienne église, se situe à la rue Baille Cariotte.
L’église fut utilisée jusqu’à la fin des années 80, moment auquel elle fut fermée pour délabrement intérieur. Ce n’est qu’une décennie plus tard que l’annonce de sa restauration fut faite lors du discours du Bourgmestre Yvon Biefnot le 21 juillet 1997. Suite à quelques problèmes administratifs, c’est finalement en 2003 que commencèrent les travaux pour un montant de 500000€. Inaugurée le 9 novembre 2003 en présence de l’Evêque de Tournai, Guy Harpigny, du Bourgmestre Patrick Piérart et du collège Echevinal, la cérémonie religieuse fut célébrée par le curé Stéphane Lassoie. Il est plaisant de revoir une église ressuscitée et de réentendre enfin sonner la cloche, cela prouve, si besoin est que Warquignies est un village qui perdure et fait face aux aléas de la vie.
(Sources : L’histoire de Warquignies de Jean Gilloteaux, Publication n°6 du Cercle d'histoire et d'archéologie de Saint-Ghislain et de la région)